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    重庆师范大学杜习慧团队在羊肚菌属基因组的微卫星(SSR)挖掘、种质资源评价和品种鉴定方面取得新进展


    【发布日期】:2019-05-13  【来源】:易菇网
    【核心提示】:筛选出合适的分子标记对我国目前主栽培品种构建DNA 指纹图谱和遗传多样性分析,对羊肚菌栽培品种的准确鉴定、知识产权的保护和新品种选育具有重要指导意义。
      作为我国食用菌行业近几年异军突起的一类真菌,羊肚菌在国内备受关注,隶属于羊肚菌属(Morchella),包括黑色羊肚菌、黄色羊肚菌和变红羊肚菌三大类。其中,黑色羊肚菌部分物种的成功栽培,使羊肚菌的人工种植自 2012 年起在国内迅速扩张,几乎各地均有栽培。由于羊肚菌菌种市场长期存在菌种杂乱的现象,菌种名称混乱且质量参差不齐,损害了育种者的积极性和菇农的利益。因此,筛选出合适的分子标记对我国目前主栽培品种构建DNA 指纹图谱和遗传多样性分析,对羊肚菌栽培品种的准确鉴定、知识产权的保护和新品种选育具有重要指导意义。
      近日,重庆师范大学杜习慧老师团队以国内主要羊肚菌栽培物种梯棱羊肚菌(M. importuna)、六妹羊肚菌(M. sextelata)、七妹羊肚菌(M. eximia)、头丝羊肚菌(M. exuberans)、Mel-13 和 Mel-21 为研究对象,以各物种的野生样品和不同栽培品种样品为研究材料,基于梯棱羊肚菌基因组序列,开展研究并得到以下结果:1)首次对梯棱羊肚菌基因组内 SSR 的分布和构成进行了分析,结果显示梯棱羊肚菌基因组内有 12902 个 SSR 位点构成,其中单核苷酸单元重复的 SSR 最多(66.2%),其次分别是三核苷酸(15.4%)、二核苷酸(12.1%)、四核苷酸(3.7%)、五核苷酸(1.3%)和六核苷酸(1.3%)单元重复;2)筛选出 180 对 SSR引物对上述六个物种的 24 份代表样品进行初步分析,发现 SSR 在这些物种间具有很高的转移率(87.7%),位点的扩增成功率与物种间的亲缘关系成正比;3)进而筛选出22对SSR引物对上述六个物种的127份样品进行深入分析,结果显示22个SSR位点在各物种内部具有较高的遗传多样性,同时检测到这些物种间具有杂交现象,并证实所使用的91个栽培样品均为不同的品种,具有不同的基因型,菇农所使用的菌种名称混乱,同物异名异物同名现象严重。以上研究结果在羊肚菌菌种遗传多样性分析、菌种鉴定、品种选育和知识产权保护等方面具有重要的应用价值。
      目前,该研究成果以“Hybridization, characterization and transferability of SSRs in thegenus Morchella ” 为 题 在 线 发 表 于 Fungal Biology 上 。 文 章 链 接 :https://doi.org/10.1016/j.funbio.2019.05.005
    QQ截图20190513162515
    Fig. 1 基于 SSR 标记对 127 份羊肚菌样品的群体结构分析、主成分分析和 UPGMA 聚类图
    QQ截图20190513162601
    Fig. 2 梯棱羊肚菌(M. importuna)、六妹羊肚菌(M. sextelata)、七妹羊肚菌(M. eximia)、头丝羊肚菌(M. exuberans)、Mel-13 和 Mel-21 的群体结构分析和主成分分析
    QQ截图20190513162653
    Fig. 3 SSR 位点扩增失败率与物种间的亲缘关系
     
     
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